Элис очнулась в ванной комнате незнакомого ей дома. Девушка быстро оделась, и принялась осматривать все помещения. Она сразу поняла, что по всему зданию расставлены смертельные ловушки. Элис удалось пробраться через несколько капканов, но уже на выходе металлический механизм ранит ее прямо в живот. Вдруг появляются люди в белых скафандрах, главный из них приказывает взять у девушки кровь на анализ, а тело уничтожить.
Когда труп сбросили в котлован, где лежало много ее абсолютных копий, стало понятно, что это очередной клон. Доктор Исаакс вместе с группой помощников пытаются создать совершенную копию девушки Элис, которая обладала сверхспособностями. Пока все попытки оказываются неудачными. Между тем вирус-Т, уничтожающий все живое, распространился далеко за пределы Америки. Помимо людей, он поражает и окружающую среду: все вокруг превратилось в одну сплошную пустыню, населенную зомби.
Те немногие люди, которым удалось выжить, постоянно переезжают из одного города в другой, спасаясь от зомби, которые охотятся за ними целыми толпами. Настоящая Элис передвигается на мотоцикле совсем одна. Выезжая из окрестностей Солк-Лейт-Сити, она услышала по радио призыв о помощи, сигнал привел ее к заброшенному сараю. Едва зайдя внутрь, она попадает в руки банды, которую возглавляет жестокая старуха.

Еще недавно Элис работала начальником службы безопасности в крупной секретной корпорации. Ее служащие разрабатывали экспериментальное вирусное оружие. Но однажды произошел сбой в работе, смертельный вирус вырвался из лаборатории, и все люди погибли. Но тела умерших были уже заражены «Вирусом-Т», он реанимировал мертвых и превратил их в зомби-убийц. Выжить удалось Элис и парню по имени Мэтт. Их обнаружили ученые, Мэтта отправили в лабораторию, а героиню на другой объект для исследования.
Раккун-сити – это закрытый поселок, в пригороде которого расположилась новая лаборатория под названием «Муравейник». Служащие в специальных скафандрах заходят в закрытый блок, где проходят новые испытания вируса-Т. Неожиданно ситуация выходит из-под контроля, и зараженные мутанты вырываются на свободу.
В Раккун-сити срочно отправляют группы для эвакуации. Но они вывозят из города не всех жителей, а только тех, кто есть в специальных списках. Доктор Чарльз, сидящий в инвалидном кресле, тоже попал в перечень. Он отказался выезжать без дочери, и за девочкой отправили другую машину. Пока корпорация спасала избранных людей, город охватила паника. Зомби вышли на улицы и повсюду нападали на людей. Полиция не справляется с их количеством. Едва последний автомобиль с беженцами пересек мост, его тут же заблокировали. Это был единственный выход из зараженного города.

Фильм ужасов был создан по мотивам одноименной видеоигры японского производства от компании Capcom. Постановкой кинокартины занимался британский режиссер и продюсер Пол Андерсен.
В прологе показывается история, как засланный в лабораторию корпорации «Амбрелла» шпион крадет Т-вирус. Убегая, он специально разбивает одну склянку, а выпущенный из нее элемент поражает всех оставшихся ученых. Автоматическая система охраны срабатывает и полностью блокирует все входы и выходы. По протоколу дальше в комнаты запускается отравляющий газ. Его действие убивает всех зараженных людей, чтобы не допустить распространения эпидемии.
А в это время главная героиня по имени Элис приходит в сознание. Оглядываясь вокруг себя, девушка ничего не может вспомнить: как она очутилась в помещении огромного особняка. Во время обследования комнат Элис встречает молодого человека по имени Мэтт. Он представляется ей полицейским и далее они идут вместе.
В это время в здание проникает спецотряд бойцов под командованием мистера Феста. Тот пытается выяснить у Элис с Мэттом, каким образом они тут оказались. Но никто из них не может дать вразумительного ответа. Фест знает куда надо идти, чтобы выбраться из поместья. Для получения объяснений происходящим событиям следует направиться в одно из подземелий построенных «Амбреллой» в Ракун-сити. Там есть засекреченная лаборатория под кодовым названием «Муравейник».
Продвигаясь по особняку, вскоре команда находит подземное метро и стоящий на путях поезд. Они заводят двигатели и отправляются в дальнейшее путешествие. В одном из вагонов обнаруживается человек по имени Спенсер, который, как и Элис, тоже имеет ярко выраженную амнезию. Разговаривая с ним, героиня начинает вспоминать, что когда-то этот мужчина был ее мужем.
Дальнейшие флэш-бэки постепенно полностью восстанавливают забытые события. Элис и Спенсер понимают, что следует попасть в «Муравейник» и обезвредить компьютерный мозг под названием «Красная Королева».